Η έδρα της Ελληνικής Ολυμπιακής Επιτροπής βρίσκεται στην οδό Δημητρίου Βικέλα 52 στην περιοχή του Χαλανδρίου και σε απόσταση περίπου εκατό μέτρων από το Ολυμπιακό Στάδιο της Αθήνας. Το κτίριο όπου στεγάζονται από το 1999 οι υπηρεσίες της ΕΟΕ, διαθέτει αμφιθέατρο 300 ατόμων εξοπλισμένο με όλα τα σύγχρονα τεχνικά μέσα, μία μεγάλη αίθουσα συνεδριάσεων και τριώροφο υπόγειο πάρκινγκ.
Η ΕΟΕ διοικεί, διαχειρίζεται και μεριμνά για τη συντήρηση των εγκαταστάσεών της όπως:
Το Παναθηναϊκό Στάδιο
Το Ολυμπιακό Κολυμβητήριο στην Αθήνα
Το νεοκλασικό κτίριο της οδού Καψάλη στο Κολωνάκι (όπου στεγαζόταν η ΕΟΕ μέχρι το 1999)
Τις εγκαταστάσεις της στην Αρχαία Ολυμπία όπου φιλοξενείται η Διεθνής Ολυμπιακή Ακαδημία
Το Μουσείο Σύγχρονων Ολυμπιακών Αγώνων στην Ολυμπία
Το Ολυμπιακό Αθλητικό Κέντρο Αθηνών (ΟΑΚΑ) που κατασκευάστηκε σε έκταση της ΕΟΕ και για αυτό συμμετέχει με εκπροσώπους της στη διοίκησή του.